上海生科院揭示胸腺嘧啶水解酶底物特異性的分

文章来源:Erron 时间:2018-12-27

  

上海生科院揭示胸腺嘧啶水解酶底物特異性的分子基礎含蓄幹凈和催化機制

  上海生科院揭示胸腺嘧啶水解酶底物特異性的分子基礎含蓄幹凈和催化機制

 

  

  10月1日,國際學術期刊Nucleic Acids Research 在線發表瞭上張馳說,團隊如今的壓力很大,工夫緊迫,當前市場逐步起來瞭,能夠過兩年就不是最佳切入期,團隊希望近期至多能將其中一類機器人的技術產業化海生命科學研讨院生物化學與細胞生物學研讨所國傢蛋白質科學中心(上海)丁建平研讨組的最新研讨结果:Molecular basis for the substrate specificity and catalytic mechanism of thymine-7-hydroxylase in fungi,該研讨任务提醒瞭真來源:第一電動網2、前9月純電植物流車累計產量達7225輛閱讀原文據第一電動研討院數據統計顯示,2015年前三季度純電植物流車累計產量達7225輛,相比上半年2536輛的產量,僅第三季度產量就達4689輛,接近上半年產量的近2倍菌胸腺嘧啶水解酶T7H底物特異性的分子基礎和催化機制。

  DNA胞嘧啶的甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾,在很多生物學過程中發揮重要作用,屬於雙加氧酶傢族的TET蛋白參與瞭DNA的主動去甲基化過程。哺乳動物中TET蛋白催化5-甲基胞嘧啶(5mC)到5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)的多步氧化反應,該催化過程與真菌中胸腺嘧啶水解酶T7H催化的從胸腺嘧啶(T或5mU)到5-羥甲基尿嘧啶(5hmU)、5-醛基尿嘧啶(5fU)和5-羧基尿嘧啶(5caU)的多步氧化反應過程在化學特性上存在很多类似之處,且TET和T7H均為雙加氧酶超傢族成員。雖然TET蛋白與包括5mC修飾堿基的DNA復合物的晶體結構已經被報道,但TET蛋白識別和區分胞嘧啶C5位差别修飾基團以及催化5mC發生連續氧化反應的分子機制仍不清晰。因而,研讨T7H的底物特異性識別和催化機制能够增進對TET蛋白結構和功用的了解。

  丁建平研讨組的博士研讨生李文婧等人解析瞭真菌Neurospora crassa來源的胸腺嘧啶水解酶T7H的原酶方式、輔因子a-KG結合方式以及差别底物結合方式(結合a-KG和T、5hmU或5fU)的高分辨率的晶體結構 。結構和生化剖析結果标明,T7H隻能在輔因子存在的情況下結合底物,且差别底物的結合不會導致活性位點發生顯著構象變化。活性位點的氨基酸殘基Phe292、Tyr217和Arg190在底物結合、催化反應過程中發揮重要作用。T7H與差别底物之間略有差異的親和力和催化活性遭到底物C5位修飾基團與輔因子和蛋白之間互相作用的影響。催化反應結束後,產物被首先釋放,然後新的輔因子和底物結合到T7H的活性位點開始新的氧化反應 。此外,T7H與TET蛋白的結構比較闡明瞭T7H催化遊離堿基而非DNA中修飾堿基的結構基礎。這些研讨结果提醒瞭T7H底物特異性的分子基礎和催化機制,並為TET蛋白底物特異性的分子基礎和催化機制提供瞭新的見解。

  上海同步輻射光源17U線站和國傢蛋白質科學研讨設施(上海)19U線站在實驗數據搜集中提供瞭撑腰與幫助 。該項研讨任务失掉瞭國傢科技部、國傢自然科學基金委和的經費撑腰。